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【机读机译|文献速递】结构|蛋白质结构中的θ曲线拓扑

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【机读机译|文献速递】结构|蛋白质结构中的θ曲线拓扑 JPEG Origin Image Download
原文:Theta-curves in proteins
DOI:   https://doi.org/10.1002/pro.5133
原文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/pro.5133?af=R&sid=researcher&utm_source=researcher_app&utm_medium=referral&utm_campaign=RESR_MRKT_Researcher_inbound&sid=researcher

省流文稿:
这项研究系统地分析了在天然折叠的蛋白质结构中,连接顺序和非顺序氨基酸的电荷和共价键所形成的复杂拓扑结构,尤其是θ曲线。研究发现,蛋白质链中的复杂结构不仅包括传统的结和缠绕,还涉及到新的拓扑概念,如θ曲线,这种曲线通过非连续氨基酸之间的连接点产生。研究在蛋白质数据库(PDB)中的52个非冗余蛋白质链中识别出了七种不同类型的θ曲线,其中包括一个未被数学上完全分类的复杂θ曲线。
为了区分不同的θ曲线结构,研究引入了“结体”概念,对每条θ曲线的三条构成弧进行了分类。这种分类有助于深入理解蛋白质中拓扑结构的多样性。研究还提出了使用饼图来呈现这些拓扑数据的方法,结合了已观察到的θ曲线类型及其组成结体。这项工作为进一步探讨蛋白质结构中复杂的拓扑特征及其功能性应用提供了新工具和新思路。