【机读机译|文献速递】分子动力学指导的半理性酶改造--提高二氯硝基苯降解酶活性

原文链接：https://journals.asm.org/doi/abs/10.1128/aem.01436-23

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省流版文稿：
本研究示范了一种通用的工作流程，用于提高酶活性，该流程结合了计算和实验技术。过程从分子动力学（MD）模拟开始，这有助于预测特定突变如何改变酶的结构和动力学以改善底物相互作用。这一计算步骤使用如分子对接等工具，可视化底物在酶活性部位内的配合情况，指导选择潜在的突变热点。
在计算机预测之后，通过定点突变技术将选定的突变引入酶的序列。然后表达突变酶，并在生化实验中测试它们的活性，以验证对特定底物，本例中为24DCNB，催化效率的增加。
这种工作流程，将计算建模与精确的基因编辑和实证验证相结合，广泛适用于不同类型的酶和底物。它为迅速定制酶功能以满足特定生物技术需求提供了一个坚实的模型，特别是在降解难分解的污染物方面。