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【机读机译|文献速递】机制|10-23 DNAzyme 的催化机制

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原文:Exploring the catalytic mechanism of the 10–23 DNAzyme: insights from pH–rate profiles
DOI: 10.1039/D4OB01125B
原文链接:https://pubs.rsc.org/en/content/articlehtml/2024/ob/d4ob01125b

文稿:
10-23脱氧核酶是一种具有切割RNA能力的催化性DNA分子,因其在基因沉默治疗中的潜在应用而受到广泛关注。然而,由于对其催化机制缺乏详细理解,制约了其实际应用的发展。最新的研究通过结构分析揭示了10-23脱氧核酶的高度有序构象,尤其是G14位点的鸟嘌呤可能作为一般碱参与催化,激活2'-OH亲核试剂,从而促进RNA的切割。此外,水合金属离子可能作为一般酸在催化过程中稳定5'-O离去基团。
通过pH-速率曲线分析和G14位点的替换实验,研究提供了酸碱催化机制参与的证据,表明10-23脱氧核酶的催化机制可能涉及多种策略,包括α催化、γ催化和δ催化,这与天然核酶的机制相似。这些发现为理解RNA切割脱氧核酶的共性机制提供了重要见解,但仍需进一步的高分辨率结构分析和突变研究来全面阐明其精确机制。

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